1467 – 1477: Onin-oorlog

Juli 1467 wordt over het algemeen gehanteerd als de periode waarin de Ōnin-oorlog officieel begon, daar de gevechten toen echt uitbraken. In september dat jaar werd Kioto aangevallen. Het noordelijke deel van de stad werd verwoest en de inwoners vluchtten massaal weg.

Zowel Yamana Sōzen als Hosokawa Katsumoto stierven in 1473, maar de oorlog ging zonder hen gewoon door. Geen van beide partijen had enig idee waar de oorlog toe zou leiden of hoe er een einde aan kon worden gemaakt. Wel verloren veel clans hun grondgebieden en rechten. Ōuchi Masahiro, een van de generaals van Yamana-clan, verbrandde zelfs zijn eigen stuk van Kioto en verliet daarna het gebied. Tegen 1477, 10 jaar na het uitbreken van de oorlog, was van Kioto niet veel meer over. Geen van beide partijen had zijn doel bereikt.

Tijdens het hele gebeuren besteedde Ashikaga Yoshimasa echter weinig aandacht aan de oorlog.[3] Hij hield zich bezig met culturele activiteiten zoals dichtkunst, en het maken van plannen voor het bouwen van de Ginkaku-ji.[4]

De Ōnin-oorlog, en vooral het feit dat de shogun zich er niet mee bemoeide, lokte kleinere oorlogen tussen de daimyo’s uit. De oorlog verspreidde zich vanuit Kioto over heel Japan. In de provincie Yamashiro ontstond een breuk in de Hatakeyama-clan, waarna beide clanhelften elkaar bevochten. Op den duur waren de boeren en ji-samurai het zat, en kwamen in opstand tegen hun landheren. Ze richtten hun eigen legers op genaamd 'Ikki', welke een serieuze bedreiging gingen vormen voor de clanlegers.